La magnetoterapia se considera un agente físico atérmico o frío por lo que sus efectos biológicos no dependen como en otros agentes del aumento de la temperatura sino que tiene efectos muy sutiles a muchos niveles. Tiene una gran capacidad de penetración y un efecto relevante en el estímulo trófico del hueso y del colágeno, efecto que está vinculado a la producción local de microcorrrientes acelerando ña osteogénesis.

Es de gran utilidad en rehabilitación debido a su posibilidad de uso aún en presencia de materiales de osteosíntesis, prótesis articulares y fijadores externos.